截至2022年4月底,大亞灣區共有醫療機構224家,其中公立醫療單位7家,分別為按公立三級綜合醫院1所(中大惠亞醫院)、計劃生育服務中心1所、社區衛生服務中心5間(澳頭、西區、霞涌、西部產業園和石化工業區社區衛生服務中心);村衛生站57間,其中納入街道-村一體化管理的有32間;民營醫療機構160間,其中門診部38間,診所116間,醫務室5間,健康體檢中心1間。公共衛生專業機構1所(疾病預防控制中心)。
截至2022年4月底,全區共有編制床位854張,共有執業醫師(助理執業醫師)722人,執業護士750人,大亞灣區已形成了設施和功能相對齊全的區-街道-村三級公共醫療衛生服務體系。